Bioinformatique structurale – Lieu : Ecole polytechnique
On abordera de nombreux aspects de la structure, la dynamique, la fonction, et l'ingénierie des biomolécules (protéines mais aussi ARN et ADN). On rappellera les bases de leur stabilité; les principales propriétés du solvant; les effets qui gouvernent le repliement et la reconnaissance moléculaire. On abordera des outils de base de modélisation: alignement de séquences, modélisation par homologie, dynamique moléculaire, docking. Outre les bases théoriques (cours + TD), on manipulera ces outils à travers des mini-projets ou TPs, dans un environnement linux. Les logiciels utilisés ont un intérêt très général en biologie structurale; certains ont été co-développées par les enseignants.
Synthetic biology. Lecturers: Thomas Gaillard, Hannu Myllykallio, Yves Mechulam; 6 ECTS; 40 hours; lectures.
This course will present the main bioinformatics and molecular biology concepts used to build new biological systems of therapeutic or industrial interest. It will deal in particular with synthetic regulatory circuits, new biofuels, proteins containing non-canonical amino acids, …
Molecular structures of the cell. Lecturer: Anna Polesskaya; 6 ECTS; 40 hours; lectures.
This course will present several examples of central cellular structures, including the cytoskeleton.
Grant application. Lecturer: Researcher depending on the project; 6 ECTS; 40 hours; personal project.
Students will prepare a scientific project in the form of an application for a research grant.
