Ce cours initie les étudiants à la préparation des données et à la gestion des flux de travail dans les environnements de santé et biomédicaux. Il offre une vue d’ensemble de la manière dont les données biomédicales sont générées, stockées, traitées et gérées au sein des infrastructures hospitalières et de recherche, en mettant particulièrement l’accent sur l’interopérabilité, la qualité, la réglementation et la sécurité des données.
Les étudiants exploreront la structure et le rôle des systèmes d’information hospitaliers en tant que pilier de la gestion des données de santé, et examineront les défis liés aux sources de données hétérogènes, notamment l’imagerie, les signaux physiologiques, les données génomiques et les dossiers médicaux électroniques. Le cours présente également les principes clés de la gouvernance des données, notamment les considérations éthiques, la réglementation en matière de protection des données (RGPD) et la gestion des données de santé sensibles.
Un accent particulier est mis sur la qualité des données et les stratégies de prétraitement. Les étudiants étudieront les méthodes permettant d’améliorer et de valider la qualité des données, notamment les techniques de traitement du signal, la gestion des données manquantes et la détection des valeurs aberrantes. Le module aborde en outre les méthodes de prétraitement des images biomédicales et les flux de travail de traitement des données génomiques, en mettant en évidence la manière dont les données brutes sont transformées en formats structurés et analysables.
Enfin, les étudiants sont initiés à la conception d’essais cliniques et aux études de population, ce qui leur permet de comprendre comment les flux de travail liés aux données biomédicales soutiennent la médecine factuelle et la recherche translationnelle.
Prérequis
Connaissances élémentaires en statistiques et maîtrise des concepts liés au traitement des données. Des compétences de base en programmation (Python) sont requises pour suivre les travaux pratiques.
Évaluation
Les étudiants seront évalués à la fois sur leur compréhension théorique des flux de travail liés aux données biomédicales et sur leur capacité à appliquer des méthodes de préparation et de prétraitement des données à des ensembles de données biomédicales.
L'évaluation reposera sur un examen écrit final, des travaux pratiques et une évaluation continue par le biais de devoirs à la maison.
