Les avancées récentes et en cours dans le domaine de l’imagerie optique ouvrent de nouvelles perspectives pour l’étude de tissus biologiques intacts avec une résolution subcellulaire. Ces avancées reposent sur des concepts physiques et des technologies sophistiqués visant à surmonter les limites actuelles en matière de profondeur d’imagerie, de vitesse, de volume, de spécificité, etc. Elles fournissent des informations uniques en biologie des systèmes expérimentale, principalement en biologie du développement, en neurosciences, ainsi qu’en physiopathologie.
Ce cours se concentrera à la fois sur la physique de ces microscopies avancées et sur des applications spécifiques illustrant les nouvelles connaissances biologiques et médicales apportées par ces techniques.

Programme
Ce cours s'appuie sur le cours « Biophotonique et applications » BIO_52004_EP et aborde des techniques et des applications plus complexes.
• Propagation de la lumière et formation de l’image – Holographie
• Théorie de la focalisation : méthodes analytiques et numériques
• Aberrations et mise en forme du front d’onde – Application à l’imagerie rétinienne
• Microscopie multiphotonique avancée (1) : signaux cohérents et à polarisation résolue – Applications aux tissus conjonctifs (peau, cornée)
• Microscopie multiphotonique avancée (2) : techniques à grand volume et à grande profondeur – Applications aux neurosciences
• Imagerie de petits animaux éveillés et fibroscopie – Application aux neurosciences
• Imagerie optique rapide et à haut débit ; microscopie à feuille de lumière – Applications à la biologie du développement
• Concepts et méthodes avancés pour la super-résolution – Applications à l’imagerie cellulaire.

Pre-requis:

BIO_52004_EP - Biophotonics and Applications must be taken in parallel.